El área de investigación sobre biotecnología forestal utiliza herramientas biotecnológicas aplicadas a la propagación, conservación, protección y mejora de especies leñosas forestales como estrategia para: 

• Evitar la pérdida de la biodiversidad.
• Reducir la deforestación. 
• Fomentar el uso sostenible de los recursos agroforestales. 

Su objetivo fundamental es potenciar las cadenas de valor de los bosques y especies leñosas en general, mejorando la calidad, la producción y el rendimiento económico de una forma sostenible. 

Las investigaciones abordan: 

• Estudios de los procesos de desarrollo y de regeneración.
• Análisis de resistencia a estrés y a enfermedades nivel fisiológico, bioquímico y molecular. 
• Desarrollo de sistemas eficientes de transformación genética de embriones somáticos de especies leñosas con genes de interés. 

La investigación relacionada con esta área es realizada por el Grupo de Biotecnología de Especies Leñosas (BEL).

• Micropropagación de especies leñosas para mejorar la eficiencia en los sistemas de cultivo disponibles, incluyendo el desarrollo de protocolos para la propagación mixo y fotoautotrófica en medio líquido por inmersión temporal y continua.
• Desarrollo de sistemas de regeneración. Cultivo en biorreactores.
• Conservación de germoplasma (a medio plazo y/o crioconservación) de genotipos seleccionados y de árboles singulares, tanto de especies forestales como de variedades locales de frutales y otras especies amenazadas o vulnerables.
• Estudio de los procesos morfogenéticos a nivel fisiológico, celular, bioquímico y molecular (genómica y transcriptómica) en especies leñosas, incluyendo la regulación epigenética del cambio de fase.
• Caracterización y regulación de genes implicados en la reprogramación de células adultas y en la adquisición de la competencia para la formación de raíces adventicias y otros procesos de regeneración, así como en el desarrollo embrionario. 
• Identificación de genes implicados en la interacción planta-patógeno y, en general, en estreses bióticos y abióticos.
• Análisis de la expresión génica (qPCR, hibridación in situ) y su regulación. Análisis funcional de los genes caracterizados mediante transformación genética.
• Mejora genética de especies forestales mediante transformación genética con Agrobacterium tumefaciens.